经济适用房与商品房的本质区别：1、土地供应方式不同商品房按现行法律规定要实行土地出让，交纳土地出让金。经济适用住房不交土地出让金，土地使用权国家划拨。2、两种建设方式的优惠不同商品房是一种市场化的运作方式，而经济适用房土地使用权是通过划拨方式取得的，国家在其开发过程中减免了若干税费，所以同地段经济适用房与商品房差异要在500—800元平方米之间。3、经济适用房与商品房的价格确定方式不同经济适用房是由政府确定指导价，7项成本加3％的利润率就是经济适用房的价格。商品房价格由市场调节，政府不加干预。4、设计不同因为具有经济性与适用性的要求，所以经济适用房的面积要适中，能保证功能齐全即可。而商品房的面积却无明确要求。5、设备标准要求不同出于市场竞争的需要，许多商品房都在采用进口设备设施；而经济适用房则要选用价格适中，质量较好的材料，不能追求高档。6、操作方式不同经济适用房政府参与较多，政府划拨土地后，确定容积率、配套等基本指标后，实行招标。而商品房政府基本不予干预，由市场调节。7、销售对象不同商品房是市场化的，任何人都可能购买；经济适用房明确售给中低收入家庭。经济适用房原则上只允许一个家庭购买一套。8、两种住房享有权力不同商品房具有占有、使用、收益、处分等四种完全的所有权权力形式，随时可出售、出租、继承、赠送，交一定税费即可；经济适用房只有占有、使用、处分三权，而收益权受一定限制。出售时要补交上土地出让金。按北京市新近颁布的房改政策规定，收取标定地价的10％，但现在北京尚无标定地价，所以按销售额的3％收取。在土地收益上，4000元平方米以下的，收益全部归己；4000—5000元平方米的，80％归个人，20％归国家或产权单位；5000元平方米以上的55分成。税收上，也给予一定优惠，契税减半，一年以上，营业税免收。9、物业管理方式收费标准也要有所区别。商品房政府核定成本构成，由市场进行调节；而经济适用房政府严格规定，国家要求5角平方米以下。